PowerGetBatch

# English manual is under preparation.


■PowerGetBatchについて

液体クロマトグラフィー（LC）-質量分析（MS）のデータから、
ピークの検出、アダクトの判定、サンプル間のアラインメント、
データベース検索等による簡易アノテーションを行うソフトです。

精密質量分析（～5 ppm）を用いたノンターゲットメタボローム解析に
特化して開発されています。
化合物の推定・同定の助けとなるよう、なるべく小さなピークまで検出し、
それをもとに正確なアダクトや多価イオン、同位体ピークの判定が行える
ことが特徴です。

■動作環境

Javaランタイム環境（64bit、JRE7以上）が動作する64 bit Windows PC
で動作します。メモリ4 GB以上が推奨です。
多数のサンプルデータのアラインメントを行う場合などには、大きなメモリが
必要になります（32 GB以上など）。

■使い方

PowerGetBatch_***.zipを展開します。
コマンドプロンプトで展開したディレクトリに移動します。
以下のコマンドを実行します。

１）ピーク検出

java -Xmx2500M -jar PowerGetBatch.jar -f settingfile.txt

settingfile.txtに、処理を行うファイル等を記載しておきます。

※メモリを大量に必要とする処理の場合は、マシンの能力に応じて-Xmx
　のメモリ量を調整してください。

例）-Xmx4000M
例）-Xmx16G

２）アラインメント

java -Xmx2500M -jar PowerGetBatch.jar -al -f settingfile_alignment.txt


詳しいマニュアルは準備中です。
お急ぎの方はお問い合わせください。

■ライセンス

学術目的にはフリーでお使いいただけます。
商業目的でご使用の場合はご相談ください。

ソースコードには、下記のライセンスのライブラリが使われています。

Jakarta Oro 2.0.8
https://jakarta.apache.org/oro/
Apache License 2.0

Base64 encoder/decoder (v.1.4)
http://iharder.net/xmlizable
Public domain

■お問い合わせ

かずさDNA研究所
櫻井望 sakurai@kazusa.or.jp

